MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.04

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019761	AAG	2	6	93	98	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019761	CAA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019761	TGA	2	6	158	163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019761	ATT	2	6	183	188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019761	CGT	2	6	207	212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019761	TTC	2	6	233	238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019761	T	6	6	246	251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019761	ACT	2	6	273	278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019761	ACC	2	6	300	305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_019761	CTGTC	2	10	331	340	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_019761	TGTT	2	8	415	422	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019761	GCA	2	6	449	454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019761	CTC	2	6	462	467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_019761	CGA	2	6	505	510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019761	A	6	6	512	517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019761	TCGC	2	8	551	558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019761	CACT	2	8	616	623	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019761	TAG	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019761	C	6	6	753	758	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_019761	GCTG	2	8	785	792	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019761	AGA	2	6	797	802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019761	CAG	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019761	AAG	2	6	835	840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019761	CCG	2	6	962	967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_019761	T	6	6	1140	1145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019761	GGT	2	6	1157	1162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019761	AGT	2	6	1299	1304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019761	AAC	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019761	GTTG	2	8	1471	1478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019761	AAC	2	6	1504	1509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019761	A	6	6	1589	1594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019761	CT	3	6	1595	1600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019761	CCCA	2	8	1660	1667	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_019761	AAT	2	6	1760	1765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019761	AGT	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019761	CAT	2	6	1836	1841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019761	GTCA	2	8	1862	1869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019761	AG	3	6	1903	1908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019761	TAC	2	6	2600	2605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019761	AGA	2	6	2627	2632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019761	ATCG	2	8	2659	2666	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019761	ACT	2	6	2677	2682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019761	ACA	2	6	2686	2691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019761	CTT	2	6	2699	2704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019761	GCG	2	6	2707	2712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019761	GAA	2	6	2721	2726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019761	CA	3	6	2730	2735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019761	AGA	2	6	2736	2741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019761	TGC	2	6	2777	2782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019761	CAA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019761	CTC	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019761	AT	3	6	2966	2971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019761	TAA	2	6	2974	2979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019761	ATT	2	6	5332	5337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019761	A	7	7	5355	5361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019761	CTT	2	6	5370	5375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019761	CTAA	2	8	6487	6494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019761	CTC	2	6	7259	7264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019761	CAC	2	6	7335	7340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_019761	CTG	2	6	7346	7351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019761	ATC	2	6	7388	7393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019761	TAT	2	6	7420	7425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019761	ACTAT	2	10	7520	7529	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019761	GAT	2	6	7588	7593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019761	T	6	6	7601	7606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019761	CAT	2	6	8248	8253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019761	AAAG	2	8	8286	8293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019761	CA	3	6	8298	8303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019761	CCGTA	2	10	8315	8324	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_019761	T	6	6	8362	8367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019761	TTAG	2	8	8369	8376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019761	CAG	2	6	9643	9648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019761	GAA	2	6	9701	9706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019761	A	6	6	9750	9755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019761	GACC	2	8	9768	9775	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019761	TTGC	2	8	9891	9898	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019761	TAC	2	6	9991	9996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019761	CT	3	6	11986	11991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019761	TAA	2	6	13015	13020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019761	A	8	8	13019	13026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019761	TAC	2	6	13071	13076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019761	GTT	2	6	13544	13549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019761	ATG	2	6	13645	13650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019761	TAA	2	6	13673	13678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019761	TGC	2	6	13766	13771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019761	TTG	2	6	14869	14874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019761	A	6	6	14903	14908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019761	ATTT	2	8	14976	14983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019761	CCT	2	6	20170	20175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_019761	CT	3	6	20174	20179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019761	ACT	3	9	20619	20627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019761	CGT	2	6	22431	22436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019761	TGC	2	6	22456	22461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019761	GAG	2	6	22486	22491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019761	T	6	6	22509	22514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019761	CT	3	6	22521	22526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019761	GAA	2	6	22556	22561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019761	AGG	2	6	22587	22592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019761	GCG	2	6	23146	23151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019761	AGC	2	6	23197	23202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019761	ACT	2	6	23226	23231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019761	CT	3	6	23230	23235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019761	AGG	2	6	25926	25931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019761	A	7	7	25966	25972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019761	AC	3	6	25976	25981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019761	TACCT	2	10	26512	26521	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_019761	T	6	6	26540	26545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019761	GA	3	6	26553	26558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019761	T	8	8	26626	26633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019761	ACC	2	6	26726	26731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_019761	TA	3	6	26827	26832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019761	GGA	2	6	26845	26850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019761	T	6	6	26868	26873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019761	ACAA	2	8	26927	26934	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019761	ACC	2	6	26970	26975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_019761	TTC	2	6	26984	26989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019761	CAA	2	6	27078	27083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019761	CCAT	2	8	27103	27110	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_019761	ACC	2	6	27135	27140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_019761	TCT	2	6	27351	27356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019761	CAAC	2	8	27437	27444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_019761	CAG	2	6	27526	27531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019761	TGG	2	6	27635	27640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019761	ACATTG	2	12	31976	31987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_019761	C	6	6	31989	31994	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_019761	CCTAA	2	10	32014	32023	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_019761	CTT	2	6	32408	32413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019761	AAG	2	6	32454	32459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019761	GGACA	2	10	32461	32470	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_019761	CAG	2	6	32549	32554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019761	TCT	3	9	32574	32582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019761	GATT	2	8	32756	32763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019761	AAG	2	6	32781	32786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019761	GGTA	2	8	34343	34350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019761	TGT	2	6	40014	40019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019761	CTA	2	6	40101	40106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019761	A	6	6	42310	42315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019761	CAA	2	6	42331	42336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019761	T	6	6	42350	42355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019761	ATT	2	6	42368	42373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019761	CAA	2	6	42411	42416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019761	T	6	6	42420	42425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019761	A	6	6	42448	42453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019761	TGA	2	6	42583	42588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019761	AT	3	6	42640	42645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019761	TCT	2	6	42695	42700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_019761	C	6	6	42702	42707	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
148	NC_019761	TG	3	6	42735	42740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019761	AGA	2	6	42820	42825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019761	GAT	2	6	42854	42859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019761	AGC	2	6	42888	42893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_019761	GCA	2	6	42971	42976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_019761	TGTA	2	8	43574	43581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019761	TTGAT	2	10	43599	43608	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019761	CAT	2	6	43630	43635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_019761	TCAA	2	8	46157	46164	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_019761	TAGA	2	8	46168	46175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_019761	TC	3	6	47659	47664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_019761	ATTA	2	8	47673	47680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_019761	ATTG	2	8	47703	47710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
161	NC_019761	CTC	2	6	47752	47757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_019761	TCTT	2	8	47796	47803	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_019761	TGAG	2	8	47833	47840	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_019761	ATTT	2	8	47849	47856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_019761	GCC	2	6	47938	47943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
166	NC_019761	GTTG	2	8	48035	48042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
167	NC_019761	CGAC	2	8	48068	48075	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
168	NC_019761	ACA	2	6	48095	48100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_019761	AGGGT	2	10	48211	48220	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
170	NC_019761	TTC	2	6	48752	48757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_019761	TCA	2	6	48794	48799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_019761	CTGTC	2	10	48867	48876	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
173	NC_019761	GGT	2	6	48892	48897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_019761	GTT	2	6	49196	49201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_019761	TGA	2	6	49262	49267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_019761	AGC	2	6	49300	49305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_019761	TCT	2	6	49393	49398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_019761	AT	3	6	49425	49430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_019761	ATT	2	6	49485	49490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_019761	CTTT	2	8	49525	49532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
181	NC_019761	GGCT	2	8	49655	49662	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
182	NC_019761	CTCA	2	8	49672	49679	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
183	NC_019761	TTC	2	6	50428	50433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.